Warianty SARS-CoV-2 na świecie
Statystyka przedstawiająca udział procentowy poszczególnych wariantów SARS-CoV-2 w wybranych krajach. Wariant Omikron BA.5, który dominował podczas letniej fali zakażeń powoli, ale wyraźnie zaczyna być wypierany przez kolejny wariant BQ.1, nazywany przez media Cerberem (nie jest to nazwa oficjalna – w publikacjach naukowych jej nie znajdziecie). Tego typu statystyki powstają na podstawie sekwencjonowania próbek – nie jest to standardowa procedura wykonywana przy jakimkolwiek badaniu na obecność koronawirusa. Niestety, im mniej testów robimy, tym mniejsza jest nasza wiedza na temat skali zagrożenia. Dane na grafice przedstawiają stan na 7 listopada 2022 (nie wszystkie kraje jeszcze zaraportowały swoją sytuację na ten dzień – np. Chiny czy Indie). Źródło: ourwolrdindata.com
Mutacje w białku kolca a szczepienia przeciwko COVID-19
Wariant Omikron zawiera ponad 50 mutacji, w tym co najmniej 30 w białku kolca (Spike protein), które koronawirus wykorzystuje przy wnikaniu do ludzkich komórek. Szczepionki dostępne na COVID-19 do niedawna oparte były na „pierwotnym” szczepie wirusa zsekwencjonowanym na przełomie 2019 i 2020 roku. Wytwarzane dzięki szczepiące przeciwciała wiązały się z kluczowym regionem białka kolca, który uniemożliwiał połączenie się z ludzkim receptorem ACE2. Kolejne mutacje w tym białku powodują jednak, że przeciwciała coraz mniej skuteczniej mogą blokować ten rejon. Z tego powodu warto „zaktualizować” nasz układ odpornościowy nowszą szczepionką, która została opracowana na podstawie białka S wariantu Omikron. Więcej informacji o dostępnych szczepionkach oraz możliwość rejestracji znajdziecie na stronie: https://www.gov.pl/web/szczepimysie/szczepienie-przeciwko-covid-19 Źródło obrazka: https://cen.acs.org/pharmaceuticals/vaccines/Omicron-puts-scientists-red-alert/99/i44
Laboratorium COVID czynne w niedzielę
Jako jedno z niewielu medycznych laboratoriów diagnostycznych prowadzimy badania także w weekendy. Koronawirus nie czeka, dlatego nie warto zwlekać z badaniami i w porę zapobiec transmisji SARS-CoV-2. Na tym polega odpowiedzialność. Wynik testu antygenowego wydajemy już po 15 minutach. Badanie RT-PCR trwa mniej niż 3 godziny. Zaświadczenie w języku angielskim wydajemy gratis. Dla komfortu najmłodszych mamy bardzo cienkie wymazówki. Zapraszamy do kontaktu, chętnie odpowiemy na pytania, przygotujemy do badania i rozwiejemy wszelkie wątpliwości. ☎ Kontakt telefoniczny: +48 724 588 772 🗓 Rezerwacja terminu on-line: https://planetmed.pl/zarezerwuj-badanie/ 📍Wskazówki jak dojechać: https://planetmed.pl/kontakt/ 🇬🇧 English information: https://planetmed.pl/english/
Gold Standard Diagnostics w naszym laboratorium
Technika real time RT-PCR nie bez powodu uznawana jest za złoty standard w diagnostyce COVID-19. Molekularne podstawy tej metody gwarantują rzetelność badań, a odpowiednio dobrany sprzęt oraz odczynniki umożliwiają wykorzystanie niezwykle precyzyjnej reakcji wielokrotnego powielania fragmentów materiału do wykrywania nawet niewielkich ilości czynników chorobotwórczych w materiale od pacjenta. Rozwijając nasze laboratorium, staramy się być na bieżąco z nowościami zarówno od strony naukowej, jak i technicznej. Z tego powodu, dziś mieliśmy spotkanie z Gold Standard Diagnostics, gdzie poruszaliśmy temat aparatury do wykorzystania reakcji PCR w diagnostyce. Jak wszystko dobrze pójdzie, to może już wkrótce będziemy mogli przetestować nowy sprzęt laboratoryjny
W oczekiwaniu na wynik badania PCR…
Tak wygląda oprogramowanie termocyklera przedstawiające wykresy intensywności fluorescencji w czasie rzeczywistym (stąd nazwa Real-Time PCR). W górnym panelu widzicie kolejne cykle ogrzewania i schładzania próbki – precyzyjne dobranie temperatury oraz stabilność tej wartości są kluczowym elementem reakcji PCR. Z każdym takim cyklem możemy obserwować stopniowy wzrost sygnału związany z amplifikacją poszczególnych genów koronawirusa (lub kontroli pozytywnej). Dodatkowo, jeden z detektorów jest zarezerwowany dla tzw. kontroli wewnętrznej. Jeżeli nie zarejestrujemy z tej kontroli odpowiedniego wzrostu sygnału oznacza to, że proces ekstrakcji materiału genetycznego zaszedł nieprawidłowo i w próbce niekoniecznie może znajdować się RNA koronawirusa. W takim przypadku cały proces badania należy powtórzyć od samego początku. Jest to kolejne zabezpieczenie przed otrzymaniem fałszywie negatywnego wyniku. Jeżeli więc uważacie, że otrzymaliście w jakimś laboratorium wynik negatywny na obecność SARS-CoV-2, a test antygenowy potwierdził zakażenie to możliwe, że dane laboratorium nie stosuje kontroli wewnętrznej w odpowiedni sposób albo w ogóle. Dlatego zawsze warto dopytać…
Nasze laboratorium: Próbki z wymazem
Tak właśnie wyglądają próbki z wymazem. Po pobraniu materiału z nosogardzieli, zawartość pojemników jak najszybciej jest przenoszony do studzienek ekstrakcyjnych. W szczególnych przypadkach, tego typu próbki mogą być przechowywane do 48 godzin w temperaturze od 2 do 8 °C. Umożliwia to VTM, czyli specjalne medium przeznaczone do transportowania materiału (różowa ciecz), w którym mogą być wirusy. VTM pomaga bezpiecznie przenosić próbki, skutecznie „odczepić” materiał od wacika z wymazówki oraz odpowiedniego go ustabilizować. Ostatnio obserwujemy w naszym laboratorium coraz większe zainteresowanie badaniami PCR w kierunku wykrycia SARS-CoV-2. Niestety, często wychodzą wyniki pozytywne. Jest to dość duży problem, bo według dzisiejszych statystyk opublikowanych przez Ministerstwo Zdrowia, aż 40% wszystkich badanych próbek wskazało na zakażenie koronawirusem. Ryzyko jak widać jest wysokie, a późniejsze powikłania, tzw. long-COVID (zwłaszcza wśród osób niezaszczepionych) mogą być dość uciążliwe, a jeszcze nie mamy sezonu jesienno-zimowego…
Ozonowanie laboratorium
Ze względu na pracę z materiałem zakaźnym oraz chcąc zachować wysokie standardy czystości, regularnie ozonujemy nasze laboratorium. Mamy przez to pewność, że patogeny takie jak koronawirus są niszczone na powierzchniach i nieregularnych obiektach takich jak klamki, wszelkiego rodzaju przyciski czy sprzęt biurowy. Ozon, czyli cząsteczka składająca się z trzech atomów tlenu (O₃) jest bardzo reaktywna. Dzięki temu wykazuje silne właściwości dezynfekcyjne, powodując uszkodzenie błon biologicznych i zaburzając dalsze procesy zachodzące w mikroorganizmach. Nie inaczej jest z SARS-CoV-2, który przy kontakcie z ozonem i wywołane przez ten gaz reakcje rodnikowe zostaje skutecznie unieszkodliwiony. Biobójcze właściwości ozonu są również toksyczne dla ludzi, dlatego podczas ozonowania laboratorium jest bezwzględny zakaz przebywania wewnątrz przez kolejne 8 godzin. Wysoka reaktywność ozonu powoduje, że jest to cząsteczka nietrwała, która naturalnie po kilku godzinach rozpada się w temperaturze pokojowej do zwykłego tlenu cząsteczkowego. Oprócz ozonu, procesy dezynfekcyjne wspomagamy również promieniowaniem ultrafioletowym, które wykorzystujemy do oświetlania najbardziej narażonych powierzchni oraz…
Skuteczność szczepionek przeciwko COVID-19: Zgony
Często w komentarzach obserwujemy wiele pseudonaukowych opinii oraz bezpośrednich antyszczepionkowych ataków, które podważają skuteczność szczepionek przeciwko COVID-19. Fakty są jednak inne. Szczepionki działają i to bardzo dobrze. Według opublikowanego niedawno artykułu naukowego w The Lancet Infectious Diseases, szczepienia uratowały niemal 20 mln ludzi na całym świecie (link do publikacji: https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(22)00320-6/fulltext). Podobnie na temat skuteczności szczepionek pokazują statystyki zgonów na COVID-19, zestawione przez amerykańskie CDC (Centers for Disease Control and Prevention). Widać dość wyraźnie, że im starsza grupa osób narażonych na infekcje koronawirusem, tym większy odsetek zgonów wśród osób niezaszczepionych. Warto pamiętać, że właśnie dlatego zalecane jest szczepienie nie tylko osób starszych, ale też młodych, aby właśnie ta grupa, mimo że mniej narażona na ciężki przebieg choroby, nie zaraziła swoich dziadków i rodziców. Źródło: https://www.scientificamerican.com/article/how-to-compare-covid-deaths-for-vaccinated-and-unvaccinated-people/
Płuca po COVID-19
Bardzo działająca na wyobraźnię grafika, przedstawiająca możliwości transportu tlenu do krwiobiegu w płucach zdrowych i zniszczonych przez COVID-19. Zabliźnione płuca, które zostały uszkodzone w wyniku infekcji koronawirusem SARS-CoV-2 wykazują znaczący spadek w możliwościach pobierania tlenu z powietrza. Stąd uczucie duszności i spadająca saturacja krwi. Do zobrazowania płuc wykorzystano nowatorską technikę skanowania ksenonowego, która została opracowana przez grupę badawczą na Uniwersytecie w Sheffield. Pomiary przeprowadził zespół prof. Fergusa Gleesona z Oxford University dla 10 pacjentów od 19 do 69 lat. Źródło: https://www.bbc.com/news/health-55017301
Liczba mutacji w wariantach SARS-CoV-2
Liczba mutacji koronawirusa od pierwszych próbek pobranych pod koniec 2019 roku do obecnie spotykanych wariantów. Widać, jak postępuje ewolucja i różnorodność (a przy tym i kolejne fale zakażeń). Wiele wariantów zapewne nie zostało zarejestrowanych, ze względu na bardzo małe zdolności przenoszenia i wyparcie przez bardziej „dostosowane” wersje.