Publikacja dotycząca epidemiologii ścieków
Bardzo ważna publikacja naukowa dotycząca epidemiologii ścieków. Przedstawiono silną korelację pomiędzy wartością stężenia materiału genetycznego SARS-CoV-2 w ściekach a lokalnymi zgłoszeniami zakażeń koronawirusem. Badania dotyczyły sytuacji w Walencji (Hiszpania), gdzie pobrano 377 próbek z rożnych oczyszczalni przetwarzających ścieki od ponad 1 miliona osób. Testowanie trwało niemal rok – od kwietnia 2020 do marca 2021 roku. Pełny tekst publikacji, dostępny jest bezpłatnie pod adresem: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fviro.2021.776998/full
Polski Kongres Genetyki, Kraków 2022
Od 27 do 30 czerwca 2022 roku, część naszego zespołu odwiedziła zalany słońcem Kraków, aby wziąć udział w Polskim Kongresie Genetyki. Zapoznaliśmy się z obecnymi trendami badawczymi, dyskutowaliśmy z naukowcami z całego świata, odwiedziliśmy stanowiska firm zajmujących się biotechnologią, genetyką i medycyną laboratoryjną. Bogatsi w wiedzę i wyposażeni w dodatkowe materiały możemy dalej rozwijać nasze laboratorium, aby być jeszcze bardziej dostępni dla Was 😉
Tygodniowe zestawienie Ministerstwa Zdrowia
Dziś Ministerstwo Zdrowia podało tygodniowe zestawienie danych dotyczących zakażeń koronawirusem SARS-CoV-2 w Polsce (okres 23-29 czerwca 2022). Wykryto 2424 zakażeń, to o prawie 181% więcej względem poprzedniego tygodnia. Analogicznie, w województwie lubelskim mamy niemal 165% więcej zakażeń.
Sytuacja epidemiczna w Czechach (czerwiec 2022)
W Czechach również obserwowana jest „letnia fala koronawirusa”. Tylko wczoraj zarejestrowano 1246 nowych przypadków. Odsetek pozytywnych testów wynosi już ponad 11%. Warto zwrócić uwagę, że w Czechach wykonuje się mniej więcej tyle samo testów dziennie co w Polsce, jednak populacja tego kraju (ok. 10,5 mln) jest prawie 4 razy mniejsza od naszego. Jeżeli wybieracie się do Czech, to nie musicie robić żadnych testów – dotyczy to osób zarówno zaszczepionych jak i niezaszczepionych. Jednak patrząc na rosnącą liczbę przypadków, może warto rozważyć badanie po powrocie do Polski…
Praca przeglądowa na temat wariantu Omikron
Bardzo ciekawa praca opublikowana w styczniu 2022 roku, na temat Omikrona, który zaczął wypierać dość skutecznie inne warianty praktycznie na całym świecie. Artykuł traktuje na temat zmian w genomie względem najbardziej rozpowszechnionych wariantów, transmisyjności oraz odporności na szczepienia. Jak się okazuje, badania naukowe bardzo dobrze przewidziały to, co mamy obecnie. To jest właśnie medycyna oparta na dowodach (EBM – Evidence-based medicine). Dostęp do publikacji jest bezpłatny. Link do publikacji „Omicron variant of SARS‐CoV‐2: Genomics, transmissibility,and responses to current COVID‐19 vaccines„: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35023191/
Sytuacja epidemiczna we Francji (czerwiec 2022)
Tymczasem we Francji również obserwowana jest „letnia fala koronawirusa”. W ciągu ostatnich 2 tygodni wyraźnie wzrosła ilość wykrytych zakażeń SARS-CoV-2. Odsetek pozytywnych testów wynosi już prawie 25%. Jeżeli wybieracie się do Francji, to pamiętajcie: Dla osób niezaszczepionych (lub bez pełnego cyklu szczepień) wymagane jest zaświadczenie o negatywnym wyniku testu badania PCR (do 72 h przed wylotem) lub testu antygenowego (do 48 h przed wylotem). Za osoby w pełni zaszczepione uznaje się, te które przyjęły 2 dawki, z czego ważność drugiej dawki nie może przekraczać 9 miesięcy, a ważność 3 dawki wynosi 12 miesięcy. Zaświadczenie o przyjęciu pełnego cyklu szczepień jest ważne jest ważne po 7 dniach po przyjęciu dawki, a w przypadku szczepionki Janssen, po upływie 28 dni. Takie osoby są zwolnione z testu. Jeżeli posiadasz dokument potwierdzający przebycie choroby COVID-19 (status ozdrowieńca) w okresie od 6 miesięcy do 11 dni przed podróżą, nie musisz wykonywać testów.
Wpływ lockdownu na hamowanie fali zakażeń (w Indiach)
21 czerwca 2022 roku, w Scientific Reports została opublikowana bardzo ciekawa praca, pokazująca jak lockdowny są w stanie wyhamować przebieg fali zakażeń. Badania dotyczą sytuacji w Pune, jednego z największych miast zachodnich Indii (populacja obecnie wynosi prawie 7 mln) w okresie od 1 lutego do 15 września 2020 roku. Bazując na danych dotyczących zakażeń z programu nadzoru zdrowia publicznego sporządzono statystyki tygodniowych wzrostów zachorowań na COVID-19, wyznaczono wskaźniki zakażeń i krzywe przebiegu epidemii w zależności od statusu blokady (lokalna lub ogólna). Zestawiając to z modelowanym przebiegiem fali zakażeń „bez interwencji” okazało się, że tego typu obostrzenia wyhamowały rozwój epidemii w mieście i przesunęły pik zakażeń o 8 tygodni. Cała publikacja z dodatkowymi statystykami, a także podziałem na grupy wiekowe oraz regiony dostępna jest na stronie: https://www.nature.com/articles/s41598-022-14674-0
Książka: „Bezpieczeństwo personelu medycznego w dobie COVID-19”
Kolejna książka godna polecenia, jaka trafiła na nasze laboratoryjne blaty to „Bezpieczeństwo personelu medycznego w dobie COVID-19” pod redakcją naukową Tomasza Dzieciątkowskiego, Krzysztofa Filipiaka (autorzy wcześniej polecanej książki „Koronawirus SARS-CoV-2. Zagrożenie współczesnego świata”) oraz Łukasza Szarpaka.
Drzewo filogenetyczne SARS-CoV-2
Drzewo filogenetyczne SARS-CoV-2. Bardzo wyraźnie widać jak wirus mutuje w czasie. Dzięki sekwencjonowaniu genomu koronawirusa możemy obserwować „na żywo” ewolucję. Z jednej strony piękno nauki, z drugiej strony rosnące zagrożenie epidemiczne…
Tygodniowe zestawienie Ministerstwa Zdrowia
Dziś Ministerstwo Zdrowia podało tygodniowe zestawienie danych dotyczących zakażeń koronawirusem SARS-CoV-2 w Polsce (okres 15-21 czerwca 2022). W tym okresie wykonano 22904 testów, z czego 1341 uzyskało wynik pozytywny (5,85%). Liczba zakażonych wg województw: mazowieckie: 321, śląskie: 176, małopolskie: 132, dolnośląskie: 100, wielkopolskie: 76, łódzkie: 67, pomorskie: 67, lubelskie: 65, kujawsko-pomorskie: 52, podkarpackiego: 49, podlaskie: 41, zachodniopomorskie: 40, świętokrzyskie: 35, opolskie: 33, lubuskie: 21, warmińsko-mazurskie: 18.